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特定菌株分离培养

目前二代高通量测序已经成为研究肠道菌群结构常用的一种方法,该方法仅仅可以得到样本中微生物的种类和相对丰度,但是无法拿到具体菌株。

微基生物专注微生态研究和应用,不仅具有二代高通量测序平台,而且还建立了肠道菌群需氧/厌氧分离培养平台,为客户提供高效的需氧/厌氧菌的靶向分离培养服务,帮助客户获得特定菌株。

 可培养的样本

客户可提供动物或人的粪便样本

土壤、淤泥等环境样本也可进行分离培养

 目标菌株

特定数量的特定菌株,比如一株或两株菌

样本保存和寄送

在客户取样之前,微基生物为客户提供厌氧活菌保存液,客户将采集的新鲜样本放入厌氧活菌保存液中,寄回到微基生物。

检测流程

1 首先通过二代高通量深度测序技术,检测样本中微生物的种类及其相对丰度.

2 确定样本中是否存在客户感兴趣的目标菌株。如果存在,进行下一步实验。

在确定目标菌株的相对丰度后,通过查阅文献和资料,确定目标菌株的培养条件和培养基。

4 利用特定菌的培养基和培养条件,对目的菌进行培养,同时利用96孔板进行大规模的分离、纯化等反复操作,找到目的菌株。

5 对最终纯化好的目的菌株进行菌种鉴定,从基因水平上再次确认目标菌株。

检测流程示意图