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16S/18S FISH荧光探针设计及检测服务 常见问题及解决方案

什么是微生物FISH荧光探针设计服务?

微生物FISH荧光探针设计服务是针对特定微生物的目标基因或rRNA序列,设计并合成带有荧光标记的单链核酸探针。这些探针能够通过互补配对原则与目标序列特异性结合,并通过荧光显微镜观察到荧光信号,实现对微生物的定性和定量分析。

微生物FISH检测服务的实验步骤是怎样的?

1  探针的设计与合成,我们根据微生物的目标序列提供特异性探针。

2  样本固定,保证细胞形态和核酸结构的完整性。

3  样本的通透处理,使探针能够顺利进入细胞并与目标序列结合。

4  杂交过夜,将探针与样本在特定条件下孵育以保证充分结合。

5  洗液洗涤,去除多余探针及非特异性结合探针以减少背景信号。

6  使用荧光显微镜进行结果观察和记录。

客户需提供样本:细胞培养物、组织切片或微生物群体样本等。还需提供目标微生物的基因序列信息或GeneID。技术人员会根据样本类型和目标微生物,选择最合适的实验条件,确保高特异性和高灵敏度的检测结果。

 

使用FISH技术进行微生物检测有哪些优势?

高特异性:特异性探针只与目标序列结合,从而可实现对目标微生物的精确检测。

可视化:直接在细胞或组织中观察目标序列的表达和分布。

安全无污染:使用荧光标记无放射性,操作安全,无污染风险。

多重检测:可以同时使用不同荧光标记的探针进行多个目标的检测。

适用性广泛:适用于不同来源的样本及各种类型样本。

 

微生物FISH检测可能出现哪些结果,如何解读?

阳性结果:观察到预期的荧光信号,表明目标序列存在。

阴性结果:未观察到荧光信号,可能表明目标序列不存在或表达水平低于检测限。

非特异性结合:可能观察到背景荧光,需要通过优化实验条件减少。

 

微生物FISH检测中可能影响实验结果的因素?

1  样本的质量细胞活力核酸完整性切片厚度等。

2  探针的质量特异性存放条件浓度等。

3  杂交和洗涤条件,温度、时间、溶液pH等。

4  荧光显微镜的分辨率和灵敏度,影响信号的检测和分析。

 

微生物FISH检测荧光探针的怎么选择

下表列出了目前荧光显微镜中常见的4种荧光通道:DAPI、FITC、Texas Red和CY5的滤片波长范围,与其最匹配和兼容的荧光基团种类,同时注明了这些荧光基团的主要应用(如抗体标记、蛋白表达或FISH探针标记):

FISH探针荧光标记的选择

请注意,这些数值和建议的荧光基团是基于常见的荧光显微镜滤光片设置和荧光染料的特性在实际应用中,建议参考显微镜的用户手册、滤光片制造商的规格以及荧光染料供应商的信息,以确保最佳的荧光信号和成像效果。

FISH探针荧光标记策略推荐(请用户结合实际情况确认):

单种细菌16S FISH标记:

目标菌标记,优先选择标记Texas Red, 兼容CY3

阴性对照:推荐FITC标记           *微基生物FISH服务可免费提供

阳性对照(细菌通用探针):CY5         *微基生物FISH服务可免费提供

DAPI通道染DNA

双色FISH探针标记(同时检测两种菌,或使用两种不同荧光标记的探针检测同一种菌):

阳性对照(细菌通用探针):FITC       *微基生物FISH服务可免费提供

目标菌1:推荐Texas Red,兼容CY3

目标菌2:推荐 CY5

DAPI通道染DNA

此种情况下,如需负对照,需在另一张片子中检测

 

如何证明检测到的荧光信号就是目标菌?

每次实验需设置标准对照:实验室在每一轮检测中均应使用标准化对照材料(阳性、阴性)。如果对照材料没有显示预期的结果,则不能对结果做出判定。

 

FISH检测和抗体检测可以一起做吗?需要注意什么?

可以联合进行,以同时观察细胞或组织中的核酸和蛋白质。需要注意固定剂的选择避免核酸酶污染、选择合适的荧光标记以及彻底洗涤以减少背景噪声。实验中还需优化杂交条件、抗体稀释比例,并进行适当的对照实验,以确保结果的准确性和可重复性。

 

完成FISH检测服务需要多长时间?

从接收样本到提供最终报告,整个过程大约需要2-4周。如客户有紧急需求,会尽量加快实验进度。

 

定制化的微生物FISH检测服务,微基生物可以提供哪些支持?

1  针对您特定研究目标的探针设计与合成。

2  根据您样本特性的实验条件优化。

3  提供详细的实验操作指导和技术支持。

4  完成实验后的数据分析和结果解释。

我们会根据客户的需求,设计并合成能够特异性结合目标微生物的探针,并确保探针的特异性和灵敏度。

 

我们致力于为客户提供满意的解决方案和优质的技术支持。