16S和18S rRNA序列是细菌/古菌和真核生物领域成员的首选靶标,因为它们普遍存在且高度丰富,由高度保守的区域和可变区域组成。FISH技术利用这些基因序列设计特异性的探针,能够精确地定位和识别目标微生物,为微生物群落结构分析、生态功能研究以及疾病诊断等领域提供了强有力的工具。
FISH检测的实验流程图:
微基生物16S/18S FISH探针设计:
探针设计确实是一个关键步骤,可以影响FISH的性能。微基生物携手格微生物经过几年研发,专为16S/18S FISH探针设计搭建了格微®甄选平台,提供专业、系统性的引物设计与评测。微基生物推出的格微®甄选 菌种特异性16S/18S FISH探针设计、合成及检测服务,将为为科研工作者提供无与伦比的16S/18S FISH探针实验体验。
微基生物已设计完成了100多种微生物“菌种”水平的16S / 18S FISH探针产品,涵盖了多种微生物目标,能够满足不同研究领域的需求。
我们提供个性化产品定制服务,欢迎致电咨询详情:021-50763698。
部分16S / 18S FISH探针商品目录
目录号 | 目标菌群 中文名称 | 目标菌群 拉丁文名 | 分类级别 | 整体小结 | 详细评测结果下载 (PDF文件) |
G16F1-taxID1716 | 棒状杆菌属 | Corynebacterium | genus | 单探针覆盖率99.28%,双探针覆盖率99.92% | 1.Corynebacterium 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F2-taxID1578 | 乳杆菌属 | Lactobacillus | genus | 单探针覆盖率97.37%,双探针覆盖率99.57% | 2.Lactobacillus 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F3-taxID286 | 假单胞菌属 | Pseudomonas | genus | 单探针覆盖率96.20%,双探针覆盖率99.38% | 3.Pseudomonas 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F4-taxID13687 | 鞘氨醇单胞菌属 | Sphingomonas | genus | 单探针覆盖率98.84%,双探针覆盖率99.89% | 4.Sphingomonas 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F5-taxID1622 | 小鼠乳酸杆菌 | Lactobacillus murinus | species | 单探针覆盖率100% | 5.Lactobacillus murinus 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F6-taxID135858 | 链状菌属 | Catenibacterium | genus | 单探针覆盖率100%,双探针覆盖率100% | 6.Catenibacterium 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F7-taxID2104 | 肺炎支原体 | Mycoplasmoides pneumoniae | species | 单探针覆盖率100% | 7.Mycoplasma_pneumoniae 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F8-taxID33038 | 瘤胃球菌 | Ruminococcus gnavus | species | 单探针覆盖率99.6% | 8. [Ruminococcus] gnavus group 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F9-taxID4929 | 吉氏梅耶酵母 | Meyerozyma guilliermondii | species | 单探针覆盖率100% | 9.Meyerozyma guilliermondii 18S基因 FISH探针设计报告 |
G16F10-taxID469 | 不动杆菌属 | Acinetobacter | genus | 单探针覆盖率95.68%,双探针覆盖率96.68% | 10.Acinetobacter 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F11-taxID418240 | 韦氏布劳提菌 | Blautia wexlerae | species | 单探针覆盖率100% | 11.Blautia wexlerae 16S基因 FISH探针设计报告 |
G16F12-taxID1763 | 分枝杆菌属 | Mycobacterium | genus | 单探针覆盖率96.56%,双探针覆盖率99.75% | 12.Mycobacterium 16S基因FISH探针设计报告 |
G18F13-taxID5477 | 白念珠菌 | [Candida] boidinii | species | 单探针覆盖率100% | 13.[Candida] boidinii 18S基因 FISH探针设计报告 |
G18F14-taxID4929 | 季也蒙迈耶氏酵母 | Meyerozyma guilliermondii | species | 单探针覆盖率100% | 14.Meyerozyma guilliermondii 18S基因 FISH探针设计报告 |
G16F15-taxID1396 | 蜡样芽孢杆菌 | Bacillus cereus | species | 单探针覆盖率96.40%,双探针覆盖率99.15% | 15.Bacillus cereus 16S基因FISH探针设计报告 |
下表列出了目前荧光显微镜中常见的4种荧光通道:DAPI、FITC、Texas Red和CY5的滤片波长范围,与其最匹配和兼容的荧光基团种类,同时注明了这些荧光基团的主要应用(如抗体标记、蛋白表达或FISH探针标记):FISH探针荧光标记的选择
请注意,这些数值和建议的荧光基团是基于常见的荧光显微镜滤光片设置和荧光染料的特性在实际应用中,建议参考显微镜的用户手册、滤光片制造商的规格以及荧光染料供应商的信息,以确保最佳的荧光信号和成像效果。
FISH探针荧光标记策略推荐(请用户结合实际情况确认):
单种细菌16S FISH标记:
目标菌标记,优先选择标记Texas Red, 兼容CY3
阴性对照:推荐FITC标记 *微基生物FISH服务可免费提供
阳性对照(细菌通用探针):CY5 *微基生物FISH服务可免费提供
DAPI通道染DNA
双色FISH探针标记(同时检测两种菌,或使用两种不同荧光标记的探针检测同一种菌):
阳性对照(细菌通用探针):FITC *微基生物FISH服务可免费提供
目标菌1:推荐Texas Red,兼容CY3
目标菌2:推荐 CY5
DAPI通道染DNA
此种情况下,如需负对照,需在另一张片子中检测
产品特点
每款探针都经过严格设计和评测,确保高特异性和高覆盖率。
每款探针都附有详细的评测报告,包括特异性、覆盖率和应用建议。
单条FISH探针特异性较差的,通过设计双探针及多条探针提高特异性。
FISH 16S rRNA检测中使用双探针的好处:
增加特异性:由于16S rRNA基因在不同细菌中具有不同的保守区域和可变区域,使用双探针可以同时靶向这些区域,从而提高对目标菌种的特异性识别。
提高检测的灵敏度和准确性:双探针可以提供双重确认,减少因单一探针可能的非特异性结合导致的假阳性结果。
适用性广泛:双探针FISH技术可以应用于多种微生物的检测,包括细菌、古菌和真菌,使其成为一种多功能的微生物检测工具。
有助于微生物群落分析:在微生物群落结构分析中,双探针可以更精确地识别和区分群落中的不同成员,为微生物生态学研究提供重要信息。
欢迎访问我们的网站,了解更多关于16S/18S FISH探针的详细信息,以及如何将这些强大的工具应用到您的研究中。微基生物科技,与您携手共创科研新篇章。