目前二代高通量测序已经成为研究人体、动物、植物等菌群结构常用的一种方法,该方法仅仅可以得到样本中微生物的种类和相对丰度,而无法拿到具体菌株。
微基生物专注微生态研究和应用,不仅具有二代高通量测序平台,而且还建立了菌群需氧/厌氧分离培养平台,为客户提供高效的需氧/厌氧菌的非靶向分离培养服务,帮助客户获得粪便、肠道、土壤、淤泥等样本中大多数菌株。
可培养样本
可培养粪便、肠道组织、土壤、淤泥、植物、药品等样本中微生物
样本保存和运输
在采样之前,微基生物给客户寄送厌氧或需氧保存液,客户可将采集的新鲜样本放入保存液汇中,寄回即可。
检测流程:
1 首先通过二代高通量深度测序技术,检测样本中微生物的种类及其相对丰度。
2 通过查阅文献和资料,确定多种培养基和培养条件,尽可能多的培养纯化菌株。
3 利用选定的培养基和培养条件,对样本中的微生物进行培养,同时利用96孔板进行大规模的分离、纯化等反复操作,尽可能纯化较多的菌株。
4 对最终纯化好的菌株进行菌种鉴定,从基因水平上再次确认菌株的分类学属性。
5 根据客户的需求,对纯化好的菌株进行扩繁培养。
菌群非靶向分离培养的实验示意图