高效筛选、高通量测序、功能菌株筛选、全流程服务
服务简介
根际微生物能够促进植物生长、提高植物抗病能力,叶际微生物在植物病害防控和植物生长调节方面也具有重要作用。通过分离培养根际/叶际微生物,可以深入了解植物与微生物的相互作用机制,为农业生产提供有益微生物资源。
微基生物提供根际/叶际微生物靶向/非靶向分离培养技术,通过多种培养条件富集培养微生物,利用96孔板进行大规模分离和纯化,得到大量纯菌株。
服务亮点
高效筛选:高通量培养组学技术显著提高筛选效率。多种培养基和培养条件。
高通量测序:结合高通量深度测序技术,提高微生物分离培养的效率和准确性。
功能菌株筛选:专注于筛选具有特定功能的微生物菌株。
全流程服务:从样本检测到菌株纯化、鉴定及扩繁,一站式解决客户需求。
服务流程
1.样本检测
对原始样本进行二代高通量测序,检测样本中微生物的种类及其相对丰度。
2.培养条件确定
确定多种培养基和培养条件,尽可能多地富集培养样本中的微生物。
3.微生物培养与纯化
利用选定的培养基和培养条件进行培养,利用96孔板进行大规模的分离和纯化。
4.菌种鉴定
对最终纯化好的菌株进行基因水平的菌种鉴定,确认菌株的分类学属性。
5.功能验证
对筛选出的目标菌株进行功能验证,确保其具备所需的特定功能。
样本类型
根际土壤样本、根表样本、叶片表面样本等。
根际微生物取样
1.抖落法:小心挖取植物根系,轻轻抖动根系,使松散附着的土壤掉落,收集紧密附着在根系表面1-2mm厚的土壤,这部分土壤富含根际微生物。
2.冲洗法:将整株植物根系小心取出后,用无菌水轻柔冲洗,收集冲洗液,其中含有从根系表面洗脱的根际微生物。
叶际微生物取样
1.擦拭法:使用无菌棉签或纱布,轻轻擦拭叶片表面,将附着的微生物收集到棉签或纱布上。操作时要注意避免损伤叶片,且需对不同部位叶片进行多点取样,以保证样本代表性。
2.振荡法:把采集的叶片放入装有无菌缓冲液的容器中,通过振荡使叶际微生物从叶片表面脱离到缓冲液里。振荡频率和时间要严格控制,防止过度振荡破坏微生物结构。
样本保存与寄送
采集后的样本需立即置于微生物活菌保存液中,尽快置于-80℃冻存。
所有样本采集完成后,使用冰盒邮寄至检测公司。
案例分享
番茄根际细菌的分离与鉴定(High-Throughput Detection of Siderophore Production of Rhizobacteria.2022)
本文分别从不同地区选取番茄植株,采集根际样品,从中分离出大量可培养根际细菌,并利用16s rRNA测序技术对其鉴定分类。
样本类型:非根际土壤、根际土壤
研究方法:通过16S rRNA测序和铁载体检测,分离并鉴定根际细菌。
研究结果:成功分离和鉴定出2150株根际细菌,揭示了根际细菌的多样性和分类特征。
为植物根际细菌的功能研究提供了丰富的资源。
番茄根际细菌的分离与鉴定示意图
2150株根际分离细菌的多样性和分类

微基生物提供根际/叶际微生物分离培养服务,提供从样本检测到菌株纯化、鉴定及功能验证的全流程服务!