高宿主DNA污染微生物样本检测服务

高宿主微生物样本（即宿主DNA占比90%以上）在微生物多样性检测中，微生物信号易被宿主序列淹没，存在有效数据利用率低、群落解析偏差大、样本适配性差等核心问题。

微基生物依托前沿科研成果与技术积累，搭建了从样本采集、宿主核酸去除、文库构建、深度测序到生物信息学分析的全流程优化体系，实现高宿主样本中微生物的精准、高灵敏度解析，检测成功率与数据可靠性远超行业平均水平，为科研工作者提供稳定、可靠、高灵敏度的专业检测服务。

一、高宿主DNA污染微生物常见样本类型

临床样本：呼吸道样本（支气管肺泡灌洗液、痰液、唾液等）、肿瘤组织样本、皮肤拭子等；

食品样本：乳品种类、发酵食品、生鲜食品基质样本等；

环境样本：各类含高宿主/宿主类杂质的环境拭子、水体沉积物等；

二、高宿主DNA污染样本检测难点

有效测序数据利用率极低：宿主DNA占比超90%，微生物序列被大量宿主序列淹没，导致有效测序数据利用率极低，难以捕捉痕量微生物的序列信息。

微生物检测偏差显著：宿主DNA干扰会引发微生物群落偏差，PCR扩增效率低等问题，无法真实反映样本中微生物的实际组成与丰度。

常规处理方法弊端突出：常规宿主去除方法操作繁琐、对样本要求严苛（如不适用于冻存样本）、易造成微生物DNA损失、引入系统性偏倚等，严重影响检测结果的可靠性。

低生物量样本测序失败率高：部分高宿主样本同时存在低生物量特征，常规实验流程难以满足文库构建要求，易导致测序实验失败。

三、高宿主呼吸道样本宿主DNA去除方法的科研验证

文献：Host DNA depletion on frozen human respiratory samples enables successful metagenomic sequencing for microbiome studies.    

本研究围绕冷冻无保护剂的人类呼吸道高宿主样本开展宿主DNA去除方法的系统评估，为高宿主样本宏基因组测序提供标准化方案。

1.研究样本：高宿主冷冻人呼吸道样本：支气管肺泡灌洗液（BAL）、鼻拭子、痰液

2.实验设计：系统评估lyPMA、Benzonase、HostZERO、MolYsis、QIAamp 5种主流宿主DNA 去除方法的效果，设置未处理对照组，同时设立模拟微生物群落阳性对照、试剂空白阴性对照；通过qPCR定量、深度宏基因组测序、微生物分型、功能预测、微生物活力验证等多维度分析，结合因果中介分析、PERMANOVA等统计方法，全面验证宿主去除方法的效率、特异性、低偏倚性。

3.实验结果展示

 

高宿主呼吸道样本宿主DNA去除实验设计框架

本研究对支气管肺泡灌洗液（BAL）、鼻拭子、痰液三种呼吸道高宿主样本，设置未处理对照组与5种宿主DNA去除处理组，同时设置模拟群落、试剂阴性对照，通过qPCR、宏基因组测序、微生物分型、功能预测等多维度分析，验证不同去除方法的效果。

按样本类型分层的微生物（非病毒）和病毒宿主属相对读长丰度图

A/B：危重患者BAL样本，A为前10非病毒微生物物种，B为前10病毒宿主属（以细菌属为单位，因DNA病毒多为噬菌体，按宿主属表征）；

C/D：健康成人鼻拭子样本，C为前10非病毒微生物物种，D 为前10病毒宿主属；

E/F：pwCF患者痰液样本，E为前10非病毒微生物物种，F为前10病毒宿主属；

结果显示：宿主DNA去除可有效提升微生物有效测序深度，显著降低高宿主样本的测序失败率，同时能清晰解析样本中微生物的群落结构。

按样本类型和处理方法分层的微生物α/β多样性图

A：微生物α多样性；B：病毒α多样性，（BAL样本多数无病毒读长，仅展示鼻拭子和痰液）；

C：微生物β多样性，表征处理组与未处理组的群落结构差异；

D：病毒β多样性，BAL 样本因病毒检测失败未纳入。

结果显示：宿主DNA去除可显著提升高宿主样本的微生物物种丰富度。

微生物（非病毒）和病毒宿主属的差异丰度火山图

全样本水平的非病毒微生物物种（A）和病毒宿主属（B）差异丰度火山图

结果显示：样本类型对微生物和病毒丰度的影响远大于宿主去除处理，体现出呼吸道微生物群落的固有样本特异性；宿主去除对部分类群丰度存在物种特异性效应，且噬菌体与其细菌宿主的丰度变化无强协同性，这或与噬菌体分布、细菌细胞壁特性相关。

实验结论：本实验证实宿主DNA去除是高宿主呼吸道样本测序的必要操作，方法选择需适配样本类型（QIAamp为通用优选），样本保存处理需注意冷冻保护与痰液样本的胞外DNA问题；同时验证冷冻无保护剂样本可实现高效宿主去除，还确定0.5-2百万微生物reads为该类样本测序深度的饱和阈值，为相关研究提供了实用方案和参考。

四、微基生物服务优势：

高成功率：全流程优化体系适配各类高宿主样本，检测成功率远超行业平均水平，解决低生物量、高宿主样本测序失败率高的问题。

高灵敏度：高效宿主去除+深度测序+精准分析，可捕捉样本中丰度低至痕量的微生物信号，真实反映微生物群落组成。

低偏倚：定制化宿主去除方案结合严格的质控体系，最大限度降低微生物DNA损失与群落结构偏倚，检测结果更可靠。

强兼容：支持冷冻、FFPE、新鲜等多种保存状态的样本，适配临床、食品、环境等多领域研究需求。

全流程服务：提供从样本采集指导、实验操作、测序到数据分析的一站式服务，配套详细的研究报告，满足科研论文发表、课题研究等多种需求。

微基生物始终以科研需求为导向，专注于微生物检测技术的创新与科研转化，以专业的技术体系、严格的实验质控、个性化的科研服务，为高宿主DNA污染样本的微生物组学研究提供最优技术解决方案，助力科研工作者攻克技术难点！详情咨询：021-50763698.