首页 > qPCR ddPCR > 引物设计&验证

引物设计&验证

针对日益研究火热的微生物,微基生物新推出qPCR引物设计及验证,可以提供细菌菌株、菌种、菌属特异性qPCR检测引物设计及验证。

客户提供信息

对于菌株特异性qPCR引物设计服务,客户需提供该菌株拉丁文全名或该菌株的测序结果(建议提供全序列而非16S全长序列)。

对于菌属特异性qPCR引物设计服务,客户需提供属的拉丁文全名。

服务流程

      

图片1

 1 通过查询菌株或菌属的序列信息,构建目的菌群全基因组数据库;

 2 设计特异性引物

 3 特异性引物合成、验证及优化

 4 菌株/菌属特异性qPCR大规模检测  

 

 代表性案例

产假单胞菌菌株ATCC 25775引物设计验证

该菌株目前没有文献发表相关引物,我们从NCBI下载了该菌的全基因组(该菌株的GC含量在30%左右),构建该菌株的数据库,之后通过生物信息学方法来设计引物(有SYBRGREEN法和探针法)。合成质粒后,对设计的质粒进行扩增效率的测试,最终的扩增效率(E值)在TE空白体系DNA背景扩增体系内,分别达到98.8%和100%。

探针法:

图片3

图片2

        

SYBR GREEN法:

图片4

溶解曲线:

图片5