宏病毒组

简介：

宏病毒组（Virome）是在宏基因组学理论的基础上，结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支。 宏病毒组直接以样本中所有病毒的遗传物质为研究对象，能够快速准确的鉴定样本中所有的病毒组成，不仅在病毒发现、病毒溯源、微生物预警等研究方面具有重要作用，在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。宏病毒组学应用广泛，可应用于人或动物肠道或者血液样本、水样、土壤样本等的研究。

样品采集

微基生物为客户提供样品采集的配套工具，如采集盒、取样勺和保存管等。

送样要求

样本量：

粪便：≥1g；

肠道内容物≥1g

组织样本≥2g

血液样本≥5mL（血液样本建议送血清）

土壤，沉积物等≥5g

清澈水体或海水：20L以上超滤浓缩或者FeCl₃沉淀后送样；

 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用干冰运输。

 

DNA/RNA等核酸样本

(1) 样品需求量：≥1μg；

(2) 样本浓度：≥50ng/μL；

(3) 样品纯度：OD260/280在1.8-2.0之间，确保DNA完整无降解；

(4) 对于本类型样品，在检测完样品的质量合格后，方可进行后续实验。

技术路线

 数据分析路线

测序平台

Illumina检测平台；PE150测序策略

部分结果示例

不同粪便样本病毒物种组成分析

eggNOG功能注释

不同粪便样本病毒多样性分析

PCA分析

以上结果示例节选自参考文献

Intestinal Virome in Patients With Alcoholic Hepatitis

原文链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8159727/

Multi-omics analyses show disease, diet, and transcriptome interactions with the virome

原文链接：https://www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(21)03234-0/fulltext