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标签归档:16S rRNA

扩增子测序

扩增子测序

扩增子测序是指利用PCR-DGGE、二代高通量测序、三代高通量测序等平台对土壤、水体、粪便、肠道内容物、唾液、皮肤等样本中的16S rRNA基因/18S rRNA基因/ITS/功能基因等进行检测,检测样本中微生物的种类和相对丰度。

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细菌或原核生物16S rRNA

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细菌的核糖体RNA(16S rRNA)普遍存在于原核细胞中,其含量较高、拷贝数较多,模板便于获取,功能同源性高,遗传信息量适中,适于作为细菌多样性分析的标准。微基生物根据客户需求,针对细菌16S rRNA基因的不同V区设计PCR引物,针对不同样本开展个性化分析。

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古细菌多样性分析16S rRNA

Ammonia Oxidizing Bacteria (AOB)

古细菌多生活在各种极端的生态环境中,它们代表了生命的极限,确定了生物圈的范围。古细菌分为泉古菌、广古菌、初古菌和纳古菌。具有代表性的古细菌有极端嗜热菌、极端噬盐菌、极端嗜酸菌、产甲烷古菌、嗜热菌、噬盐菌等。

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视频资料

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本视频主要介绍了16S rRNA在微生物多样性中的应用,主要内容包括16S rRNA简介、16S rRNA作为进化标尺的选择依据、16S rRNA的V区选择、16S rRNA多样性检测流程、进化树介绍、常用数据库介绍。

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