实测！粪便微生物DNA常温保存液是一种高效便捷的样本保存方式

肠道菌群与人类及动物健康的关系密切，通过检测肠道菌群可以获得有关健康的信息。新鲜粪便不易获得，很难做到快速低温冷冻，在进行标准化和大规模样本采样时，可用于常温条件下采集和保存样本的保存液可以弥补采集样本数量多、地域分布广、现场采样条件多样、工作量大、运输条件差等条件不足。

微基生物子公司研发的格微®粪便微生物DNA常温保存液有效的保证粪便样品中微生物的DNA在常温环境下不被降解,粪便样本中微生物的数量,组成和丰度保持稳定,保证肠道菌群测序后数据分析的准确性。

 

  

格微®粪便微生物DNA保存液应用实例 

 

采取两个志愿者的新鲜粪便（取后排出的中间部分，避免粪便表面的黏膜，更能很好的体现肠道微生物类群），分别分装为12管，其中3管立即冻存于-20℃，作为平行实验及正对照，其余9管置于37℃水浴锅中，恒温保存3天，7天，14天。取样后立即冻存于-20℃，用于后续基因组抽提。

采取QIAamp DNA Stool Mini Kit进行基因组抽提，电泳检测进行质控，结果如下图所示，浓度为10-20ng/uL。

以抽提基因组DNA为模板，进行16S V4-V5区扩增，并通过PCR扩增的方法添加测序所需接头，PCR结果如下图所示：

将PCR产物回收定量等摩尔比混匀，质控合格的文库进行illumina Miseq测序。

拿到测序的结果，序列拼接和质控后，进行生物信息学和统计分析：

 

通过聚类OUT的α多样性分析

相同样本在保存液中保存14天结果与新鲜冻存的样本无显著差异（P>0.05）。

 

Alpha多样性（Alpha diversity）是对单个样品中物种多样性的分析，其中shannon index和Simpson index是对物种richness进行分析，ace和chao是对物种diversity进行分析。

 

基于系统发育的β多样性分析

通过PCoA分析，发现weighted UniFrac和unweighted UniFrac的结果显示，不同处理时间样本之间的相似性很高，图中每个样本的不同处理分别聚在一起。新鲜冻存与37℃处理14天从系统发育角度看无显著差异。

 

       

Beta多样性（Beta diversity）分析是用来比较样品之间在物种多样性方面存在的差异大小。UniFrac是通过利用系统进化的信息来比较样品间的物种群落差异。UniFrac结果分为加权UniFrac（weighted UniFrac）与非加权UniFirac（unweighted UniFrac）2种，其中weighted UniFrac考虑了序列的丰度，unweighted UniFrac不考虑序列丰度。

对物种分类信息进行统计分析

              

在门、纲、目、科、属各水平的细菌相对丰度构成图中，每个柱子为一个处理三个重复的均值，不同颜色代表不同的物种，物种信息可见图例，若某一种细菌占的比例多，则其在柱子中所占的比例就会更大。

 

基于细菌丰富度、多样性、系统发育、菌群关系以及菌属构成，表明微基生物自主研发的粪便微生物DNA保存液可实现对DNA完整性的有效保存。

 

产品优势

1 可在常温下采集、保存粪便样品，保护样本中微生物DNA不被降解；

2 使用简单，可把粪便样品直接浸入微生物常温保存液中，保护样品中微生物；

3 从保存液中提得的微生物DNA后继可用于酶切和PCR等多种分子生物学实验；

4 保存管、采集勺均为无菌产品，最大程度减少了耗材中微生物及微生物残留DNA对样

品的污染；

5 用途广泛，可广泛用于医院、家庭、高校、科研院所等常温条件下粪便样品的采集保存。

 

 

应用案例

以下科研文章均使用了微基生物子公司研发的粪便微生物DNA常温保存液。使用保存液大大方便了样本的收集与保存，确保了研究中微生物DNA的稳定性和研究结果的准确性。这些文章涵盖了从儿童早发育、慢性自发性荨麻疹到焦虑样障碍等多个领域的研究。粪便微生物DNA常温保存液为微生物组研究提供了强有力的样本保护方案。

产品详情

货号	产品名称	应用范围	规格	单位
GWF01	集翔盒（粪便采集盒）	人粪便样本采集	18cm*25cm	个
GWF01-A	集翔盒（粪便采集盒） 粪便保存液	人粪便样本采集 及粪菌DNA常温保存	18cm*25cm，3mL	套

Fecal samples were collected within three minutes after defecation using sterile stool preservation tubes that contain stool preservation fluid and have a sterile spoon attached to the lid (GeWei Bio-Tech(shanghai) Co. Ltd.,China, Product No.GWFO1-A). 

 

1 Zhu, L., et al. (2024). Gut microbiota facilitate chronic spontaneous urticaria. Nature Communications, 15, 112.  

 

2  Weng, H., et al. (2024). Humid heat environment causes anxiety-like disorder via impairing gut microbiota and bile acid metabolism in mice. Nature Communications, 15, 5697.

 

3  Wu et al. (2024). Investigation of Human Milk as a Biological System in a Multicenter Mother–Infant Cohort: Protocol Design and Cohort Profile of the Phoenix Study. Nutrients, 16(17), 2892.  

揭秘肠道微生物奥秘：粪便微生物DNA常温保存液，让研究更精准、更便捷！