菌株特异性引物、探针设计及合成验证

针对多个目标菌株，可进行多重qPCR引物、探针设计

惊爆价9800元/菌株

菌株特异性引物、探针的设计

菌株特异性引物、探针的合成

qPCR条件优化及检测性能验证

提供：引物、探针序列及合成、qPCR扩增优化条件、标准质粒及扩增标曲的建立、扩增灵敏度、宿主基因组DNA非特异性扩增验证、6例实际样本的扩增检测

   

 

同一物种的不同菌株之间的基因多样性和单核苷酸多态性导致功能和表型的多样性

Research progress and applications of strain analysis based on metagenomic data 2020年

菌株（strain）是不同来源的某一种细菌的纯培养物。微生物组通常包含同一物种的多个菌株，并且不同菌株已被证明其功能作用具有重要差异。

同一个菌种（Species）下，常常有许多不同的菌株。

同一个菌种下，不同的菌株间，其基因组的差异可以高达30%以上。

因此特定菌株qPCR鉴定所需的引物，往往需要寻找该菌株特定的基因序列，甚至与同种的其他菌株也能明确区分开来。

菌株特异性是指引物、探针应特异性识别特定菌株中特有序列，而不能检出其他任何菌株。微基生物菌株特异性引物、探针的设计策略是基于目标微生物全基因组序列来进行排查设计，不推荐只限于16S，ITS等一段特定基因序列，这样可供筛选的基因靶点大大丰富，更有利于筛选出性能优秀的特异性引物、探针。

 

引物和探针设计服务

最重要和最具挑战性的步骤是鉴定菌株特异性序列，随后可以用特异性引物或探针靶向该序列。良好的引物或探针设计原则对于防止假阳性或假阴性结果以及提高PCR反应的灵敏度至关重要。微基生物可以根据客户的目标和要求，设计针对目标菌株的特异性引物和探针，有效促进目标菌株的检测、筛选和鉴定。

qPCR探针法检测

qPCR探针法基于合成制备的寡核苷酸与细菌DNA上特定靶序列的杂交。探针的特异性很大程度上取决于靶序列，尽管杂交条件和洗涤的严格性也很关键。高度保守的区域用于通用或基于结构域的寡核苷酸探针，而不同的可变区则用于属特异性探针；高度可变的区域是物种特异性探针的目标。

ddPCR引物特异性验证

微基生物专注微生态研究服务11年，在过去5年时间深耕菌株特异性引物和探针设计服务领域，已拥有广泛而深入的知识和经验，为客户设计验证190余种特定微生物菌群的特异性引物探针。

如果您对菌株特异性引物和探针设计服务感兴趣，请随时联系我们：021-50763698。

微基生物同时提供：引物、探针设计开发，可用于qPCR、ddPCR、多重PCR、tNGS，种、属等特定微生物群体相关的特异性探针引物设计验证服务，欢迎来询！