RDA分析(Redundancy analysis)

RDA分析(Redundancy analysis)

RDA分析，即冗余分析，对比主成分分析可以发现，其实冗余分析就是约束化的主成分分析。PCA和RDA的目的都是寻找新的变量来代替原来变量，它们主要区别在于后者样方在排序图中的坐标是环境因子的线性组合。它的优点就是考虑了环境因子对样方的影响，因为有些时候我们想得到在某些特定条件限制下（如海拔高度，PH值，酸碱度，疾病组与健康组等）物种的分布。可以得到哪些物种受特定的环境因子影响。可以得到如某些植被是受海拔高度影响，某些菌受PH值或酸碱度的影响等。

 

对数据的准备，需要两个矩阵，一个数据矩阵，一个环境矩阵，数据矩阵和pca准备数据相同，环境矩阵形式如下，如果有不能量化的环境因子（如性别，疾病与健康等）联系我们，来量化您的数据。

对数据的要求，样方的个数必须大于环境因子的个数。

	环境因子1	环境因子2
样方1
样方2