首页 > 用于微生物多样性的统计方法 > 全样本相似度与进化树分析

全样本相似度与进化树分析

全样本相似度
比较多个样品中OTU组成的差异及各OTU中含有序列的丰度,计算这些样品的相似性,并绘制相似性图谱。
图中数据标度代表遗传距离

全样品相似性
人体微生物

进化树分析

挑选各样品丰度≥0.1%的OTU的代表序列,构建系统发育树,不同颜色代表不同phylum

jinhushu