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生殖道微生态研究

  生殖道内微生态环境对妇女健康、生殖功能、婴儿出生等都有重要的作用。微生物导致生殖道环境产生某些生化或炎症反应,生育期健康女性的阴道内有大量正常寄生菌,他们通过自身产生的粘附机制与阴道上皮细胞结合,生长于阴道粘膜表面。其菌群的平衡至关重要,其不仅影响着其中定殖微生物类群,也影响着阴道内环境。而一旦受到某些因素的影响,如体内雌激素含量的变化、致病菌的侵入、长期服用抗生素等,就会使阴道pH值发发生改变,破坏阴道的自然防护,其内部的菌群失衡,就会产生相应的疾病。

  微基生物运用分子生物学结合高通量测序的方法,可以得到生殖道中绝大部分微生物的信息,并通过生信/统计分析,对大量数据进行处理和分析,找到在生殖道中与环境因子(抗生素使用、细菌性炎症等)相关的微生物群落组成,从而进行进一步的研究。

微基生物进行人体健康相关的研究与应用:

  • 肠道微生态 
  • 皮肤微生态
  • 口腔与呼吸道
  • 生殖道微生态研究

微基生物提供与人体健康相关的生信/统计服务:

物种组成图

样品群落结构分析柱状图、多样品对比树图、样品群落结构分析柱状图

微生物多样性分析/宏基因组

LEfSe差异分析

PCA差异分析

RDA环境因子分析

更多微生态方向研究和生物信息方面服务,请详询:400-660-9270

生殖道微生态分析流程

HTS

  • 样品采集及运送:

  新鲜样品:用无菌棉拭子,于女性阴道侧壁1/3处取阴道分泌物,将棉签置于无菌管中,保存于-80℃冰箱中
  DNA样品:样品需求量:≥ 300 ng;样品浓度:≥ 10 ng/μL;样品纯度:OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解

  样品运送:干冰寄运

  • 生信/统计分析
Bioinfor-statistic analysis
Bioinfor-statistic analysis

案例分析

标题:欧洲妇女产前和产后一段时间内阴道微生物的变化

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研究领域:生殖道微生物

分析物种:细菌

  (1)细菌多样性在产后妇女的阴道中明显增加

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  (2)在怀孕8周一直到产后,阴道微生物的在种水平上的组成变化图

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  (3)在英国妇女中,从产前至产后的整个过程中,阴道微生物类群的变化图(不同颜色代表不同的细菌种类)

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  (4)主要微生物类群在不同人种之间的差异

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原文链接:http://www.nature.com/articles/srep08988

参考文献:

MacIntyre, D. A., M. Chandiramani, Y. S. Lee, L. Kindinger, A. Smith, N. Angelopoulos, B. Lehne, S. Arulkumaran, R. Brown, T. G. Teoh, E. Holmes, J. K. Nicoholson, J. R. Marchesi and P. R. Bennett (2015). “The vaginal microbiome during pregnancy and the postpartum period in a European population.” Sci Rep 5: 8988.