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农业微生物|纤维素降解菌分离培养+qPCR/FISH精准检测

还在为纤维素降解菌分离难、纯化不纯、功能验证不规范原位定位无手段而困扰?

微基生物依托年微生物培养平台,紧扣高分文献实验体系,打造纤维素降解微生物菌株分离、纯化、鉴定、功能验证、条件优化、原位定位一站式技术服务,助力科研团队快速获得高活性菌株,支撑农业废弃物资源化、堆肥增效、生物基产品开发等项目落地。

 

一、纤维素降解菌分离培养核心实验与结果呈现

1.菌株定向分离与初筛

样本富集堆肥、土壤、农业废弃物选择性培养基培养透明圈初筛CMC-Na+刚果红染色多次划线纯化-80℃低温保藏交付

1纤维素降解菌刚果红染色透明圈初筛结果

2. 菌株分子与生化鉴定

形态/生化鉴定16S rRNA测序+构建系统发育树、生长曲线测定完成菌株精准分类与生长特性解析。

2纤维素降解菌菌株形态及其革兰氏染色图

3纤维素降解菌菌株生长曲线

 

3. 功能验证与酶活/降解率定量测定

采用DNS法测定纤维素酶活、滤纸条崩解试验(液体定性验证)、秸秆/蔗渣降解率测定、产酶条件优化与稳定性测试,全面评价菌株降解能力。


4滤纸降解试验结果

 5秸秆降解外观变化图


 6不同菌株秸秆降解率柱状图

4.高分文章必备:菌株定量与原位可视化

菌种特异性qPCR探针检测试剂盒:基于菌株全基因组序列设计种/株水平高特异性TaqMan探针,实现功能菌株在土壤/堆肥中的准确定量与动态追踪。

FISH荧光原位杂交检测试剂盒:定制荧光原位杂交探针,对目标功能菌原位可视化定位。

1)植物根系纵向切片展示

2)植根系纵向切片展示

蓝色荧光(DAPI染色):呈现根系样本中所有细菌的整体分布;红色荧光(FISH探针标记):定位目标功能微生物。图像叠加可直接观察目标菌在总群落中的位置与占比,快速判断目标菌的存活状态与富集情况。

选择微基生物,让纤维素降解菌株研发更高效

参考文献

1.Padhan K, Patra RK, Sethi D, et al. Exploitation of cellulose degrading bacteria in bioconversion of agro-wastes[J]. Chemosphere, 2024, 347:140654.

2.王光琴,黄莺,温明霞,等. 5株纤维菌属菌株的分离、鉴定及产酶活性研究 [J]. 中国农学通报,2021, 37 (15): 112-119.

3.程鹏,刘姗姗,王玉,等. 1株高产纤维素酶菌株的筛选鉴定及对稻秆降解的研究 [J]. 华南农业大学学报,2019, 40 (1): 84-91.

4.金海洋,等。秸秆降解菌剂对水稻秸秆还田土壤肥力及产量的影响[J]. 中国土壤与肥料,2020 (3): 168-174.

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