微基生物｜微生物宏基因组检测服务

宏基因组测序以样本中全部微生物基因组为研究对象，无需分离培养，通过高通量测序全面解析群落组成、物种分类、基因功能、代谢通路，是海洋生态、肠道微生态、疾病机制、环境修复等领域的核心技术手段。

微基生物深耕微生物科研十余年，全程提供宏基因组测序—建库—生信分析—科研支持，已助力客户发表多篇高水平论文，覆盖海洋碳汇、炎症性肠病、慢性自发性荨麻疹等前沿方向，用专业技术与成熟方案，为您的科研保驾护航。

一、客户高分文章实证：彰显技术实力

以下项目的宏基因组测序、文库构建、生信分析、数据挖掘、图表绘制及科研技术支持，均由微基生物全程提供。

（一）海洋生态领域：贝类-藻类混养DOC微生物降解机制

发表期刊：Regional Studies in Marine Science（2024）

研究核心：贝藻混养作为重要蓝色碳汇模式，其释放溶解性有机碳（DOC）的微生物降解过程与碳汇潜力尚未明确。本研究首次系统解析长牡蛎–裙带菜混养体系DOC长期微生物降解规律，为海洋碳汇机制研究提供全新证据。

研究样本：长牡蛎、裙带菜混养海水、自然海水（对照组）
实验设计：120天室内避光降解实验，设置处理组与对照组，多时间点（0/2/4/8/12/20/30/40/65/90/120天）取样检测
技术路线：样本采集→DNA提取→Illumina NovaSeq 6000测序→宏基因组组装→基因预测→KEGG功能注释→菌群与代谢关联分析

核心结果

1.贝藻混养DOC浓度呈三阶段变化，形成长效碳汇：

120天降解过程中，DOC浓度呈现：快速下降期（RD，0-4天）→缓慢下降期（SD，8-40 天）→稳定期（DS，65-120天）的规律。快速期降解36.31%，缓慢期降解30.88%，稳定期仅降解4.05%，最终剩余28.75% DOC，形成可长期储存的难降解有机碳库

图示 1：DOC浓度动态变化曲线

2.细菌群落随DOC降解发生规律性演替：

不同降解阶段的优势菌群呈现显著的功能特异性更替：

•快速降解期：α–变形菌纲、γ–变形菌纲主导，负责易降解有机物的快速利用

•缓慢降解期：浮霉菌纲占优，擅长分解复杂多糖与难降解有机物

•稳定期：菌群结构趋于稳定，降解活性显著降低

图示 2：细菌群落结构演替热图（纲水平）

3.DOC降解的微生物代谢功能具有阶段特异性：

·快速期：氨基酸代谢活跃，smtA、rbcL等固碳基因高表达

·缓慢期：碳水化合物代谢增强，负责复杂多糖的分解

·三羧酸循环（TCA）与DOC浓度呈显著负相关（p<0.001），是DOC矿化的核心通路

图示 3：KEGG代谢通路热图

（二）临床肠道领域：克罗恩病生物制剂治疗应答菌群差异

 

发表期刊：Biomedicines（2025，IF=4.6）

研究核心：生物制剂为克罗恩病（CD）一线治疗方案，但30%-50%患者出现原发性无应答或继发性失应答。本研究通过长期纵向随访，首次揭示不同治疗应答类型患者肠道菌群特征，为个性化诊疗提供菌群标志物依据。

研究样本：16例克罗恩病患者粪便样本（长期生物制剂治疗，分缓解R、轻度活跃mA、缓解转活跃R2A三组）
技术路线：宏基因组测序→α/β多样性分析→物种差异筛选→功能富集分析→临床关联验证

核心结果

1.菌群多样性与治疗应答直接相关：

R组与mA组的菌群α多样性显著高于R2A组（p<0.05），多样性越高，治疗应答越好；R 组与mA组间无显著差异。

图示 4：CD患者肠道菌群α多样性指数（Shannon、Simpson、Chao1）

2.三组患者菌群结构显著分离

基于Bray-Curtis距离的PCoA分析显示，R、mA、R2A三组菌群形成独立聚类，Adonis检验p=9×10^-5，表明不同治疗应答者的菌群结构存在本质差异。

图示 5：基于Bray-Curtis的PCoA菌群β多样性

3.筛选到治疗应答关键菌群标志物：

缓解优势菌：Akkermansia muciniphila、Bifidobacterium adolescentis、Megasphaera elsdenii

恶化富集菌：Veillonella parvula、Veillonella atypica、Klebsiella pneumoniae

图示 6：物种水平差异菌的火山图/差异倍数图

二、宏基因组测序技术路线

微基生物提供个性化实验设计、样本保存液及采样指导，搭配标准化实验操作、多维深度分析与完整报告，同步协助结果解读及图表修改，全流程省心高效。

咨询电话：021-50763698

三、参考文献

1.Hu T, Su J, Shao K, et al. Microbial degradation of DOC released by the mixed culture of Crassostrea gigas and Undaria pinnatifida[J]. Regional Studies in Marine Science, 2024, 79: 103800.

 

2.Zhao X, Xu J, Wu D, et al. Gut Microbiota in Different Treatment Response Types of Crown’s Disease Patients Treated with Biologics over a Long Disease Course[J]. Biomedicines, 2025, 13(3): 708.