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韦恩图(Venn)

  venn 图可用于统计多个样品中所共有和独有的OTU 数目,可以比较直观的表现环境样品的OTU 数目组成相似性及重叠情况。通常情况下,分析时选用相似水平为97%的OTU 样品表。
  软件:使用97%相似度的OTU,R 语言工具统计和作图
参考文献:
  Fouts DE, Szpakowski S, Purushe J, Torralba M, Waterman RC, et al. (2012) Next Generation
Sequencing to Define Prokaryotic and Fungal Diversity in the Bovine Rumen. PLoS ONE 7(11): e48289. doi:10.1371/journal.pone.0048289.
例图:

venn 12
韦恩图(venn)
venn 11
韦恩图(venn)

  注:不同的颜色代表不同的样本,如果两个不同颜色圆圈重叠的区域标注有数字100,说明这两个样品均有序列被划分入相同的OTU 中,且这样的OTU 有100 个。图中的样品数量一般为2~5 个。