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宏转录组

宏转录组是特定时期、环境样本、组织样本中所有的微生物的RNA(转录本)的集合。通过对这些转录本进行大规模高通量测序,可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。这种技术不仅具有宏基因组技术的全部优点,可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究,还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径,揭示微生物在不同环境压力下的适应机制,探索环境与微生物之间的互作机理。

技术路线:

transcriptome-line

检测平台:
Illumina PE100/125/150

结果展示:

transcriptome-KEGG

GOSlim 分类注释结果

transcriptome-eggNOG

eggNOG功能注释分类图

transcriptome-KEGG

KEGG注释图

transcriptome-pathway

代谢通路图