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靶基因检测

技术介绍:

靶基因检测是指利用PCR-DGGE、二代高通量测序、三代高通量测序等平台对土壤、水体、粪便、肠道内容物、唾液、皮肤等样本中的16S rRNA基因/18S rRNA基因/ITS/功能基因等进行检测,检测样本中微生物的种类和相对丰度。

检测项目:

  • 16S rRNA基因测序: 16S rRNA基因为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,主要进行细菌或古菌的多样性分析。
  • 18S rRNA基因测序: 18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,反映样品中真核生物之间的种类差异。
  • ITS测序: 该类测序主要对环境微生物中的真菌多样性进行分析。
  • 功能基因测序:根据客户的需求,对碳循环、氮循环等过程中起重要作用的功能基因进行测序。

检测平台:

  • 传统方法:PCR-DGGE变性梯度凝胶电泳、克隆文库;
  • 二代高通量平台:Illumina、Ion PGM;
  • 三代高通量平台:PacBio;
  • 绝对定量:Real-Time PCR

检测结果展示:

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截止到2017年年初微基生物已完成千余项微生物多样性分析项目,分析样本数万例。 研究对象涉及肠道、皮肤、生殖道、牙菌斑、粘膜、痰液、土壤、水体、发酵物、粪便等各类样本。