多组学

多组学联合分析

多组学(Multi-omics)研究是探究生物系统中多种物质之间相互作用的方法。随着微生物组学研究的不断发展，越来越多的研究者开始将微生物组学与转录组学，蛋白组学及代谢组学联合起来，通过两种或两种以上组学研究方法从物种、基因以及代谢产物等水平共同解释科学问题，更好地理解疾病病变过程及机体内物质的代谢途径。

16S 检测与代谢组学能够将样本中微生物类别或者丰度与代谢产物丰度产生关联。宏基因组与代谢组学的关联主要是其代谢通路中功能基因和代谢产物的关联。微基生物提供基因组学、代谢组学实验及数据分析服务，为肠道菌群与宿主疾病研究，肠道菌群与人体免疫，肿瘤发展/治疗等提供多组学联合分析，结果更可靠、数据更丰富。

技术路线

结果展示

差异物种与差异代谢物相关性分析

RDA/CCA分析

Network 网络分析

Network ROC分析

文献解读  

一）文章题目:Omics and multi-omics approaches to study the biosynthesis of secondary metabolites in microorganisms 微生物次生代谢产物生物合成的多组学研究（综述）

Current Opinion in Microbiology (IF: 6.710)

微生物产生的天然产物是生物活性分子的主要来源。高通量(组学)技术的发展对增加了我们对复杂的编码次级代谢产物的生物合成基因簇(biosynthetic gene clusters ,BGCs)表达机制的理解。基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和组合组学可作为发现新抗生素的有力策略。

微生物次生代谢产物生物合成的多组学研究

参考文献： Palazzotto E , Weber T . Omics and multi-omics approaches to study the biosynthesis of secondary metabolites in microorganisms[J]. Current Opinion in Microbiology, 2018, 45:109-116.

2) 文章题目:Distinct signatures of gut microbiome and metabolites associated with significant fibrosis in non-obese NAFLD 肠道菌群及其代谢物或参与非肥胖性非酒精性脂肪肝病患者的肝纤维化

Nature Communications (IF: 12.121)

主要技术：16S微生物多样性，非靶向代谢组，宏基因组

技术路线

主要结果：

非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease，NAFLD)最终可导致晚期纤维化和肝硬化。使用16S rRNA基因测序和代谢组检测分析了实验参与者的肠道微生物组及代谢产物，并对部分非肥胖NAFLD受试者样本进行宏基因组测序。非肥胖受试者的纤维化严重程度与微生物多样性的显著变化相关，粪便胆汁酸和丙酸盐升高，尤其是在具有显著纤维化的非肥胖受试者中。这项研究为微生物群在肝纤维化发病机制中，特别是非肥胖受试者的作用提供了证据。

肥胖/非肥胖受试者肠道微生物多样性比较

肥胖/非肥胖受试者微生物类群和粪便代谢物成分的分布网络比较

宏基因组分析非肥胖受试者中纤维化相关微生物菌群

参考文献：Lee G , You H J , Bajaj J S , et al. Distinct signatures of gut microbiome and metabolites associated with significant fibrosis in non-obese NAFLD[J]. Nature Communications, 2020, 11(1):4982.