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菌种鉴定

微基生物专注微生物多样性研究,为高校、医院、研究所等单位提供科研服务。不仅可以检测土壤、水体、粪便、肠道内容物等样本中混合微生物的种类及丰度,而且还可以提供细菌、真菌等纯菌的菌种鉴定服务。
土壤、水体、粪便等样本中的微生物一般为混合菌,需要在一定条件下通过培养、分离、纯化后,得到纯菌。对纯的细菌、真菌等菌种,均可进行菌种鉴定服务。
菌种鉴定一般是提取纯菌A的基因组DNA,然后PCR扩增16s rDNA片段,之后通过一代测序或三代测序检测16S rDNA的全长,与国际上的数据库进行Blast比对,默认选取比对结果中相似性最高的前10位的物种分类信息,之后构建系统发育树,最后得出样本A与XX物种的相似性最高。

技术路线:

identification-line

部分结果展示:

identification-1

Blast比对结果

identification-blast

比对结果物种分类信息注释

identification-tree

系统发育树的构建