菌种/属特异性TaqMan探针/引物设计

高特异性、高灵敏度、全流程服务，助力微生物组学研究

在微生物组学研究中，准确检测和定量分析目标菌属或菌种是揭示微生物群落功能机制的关键。微基生物依托先进的生物信息学技术和丰富的实验经验，提供基于全基因组序列的菌种/属特异性TaqMan探针/引物设计、合成及验证服务。从而实现在复杂的微生物群落背景下实现单菌种级别的绝对定量。

服务亮点 

1.高特异性与灵敏度

全基因组比对和优化设计，确保探针/引物仅与目标序列高度匹配，避免非特异性扩增。

2.灵活的检测方法

提供qPCR探针法和液滴数字PCR（ddPCR）等检测方法，满足不同样本类型和研究需求。

3.全流程服务

数据库构建到探针/引物设计、验证与优化，再到大规模检测，一站式解决实验需求。

4.可靠的数据支持

严格的质量控制和优化流程，确保实验结果的准确性和可重复性。

服务流程 

1.数据库构建

查询菌种/属的序列信息，构建全基因组数据库。

2.引物/探针设计

利用生物信息学工具，设计特异性引物或探针。

3.验证与优化

合成设计好的引物或探针，并进行特异性、扩增效率等验证和优化。

4.大规模检测

使用验证通过的引物或探针对目标菌种/属进行大规模检测。

qPCR TaqMan探针检测方法 

微基生物提供基于TaqMan探针的qPCR探针/引物设计服务。确保探针与目标序列特异性结合，通过Taq酶水解探针产生可检测的荧光信号。优化Tm值和长度，提高扩增效率和特异性。                           

 

qPCR TaqMan探针法

液滴数字PCR（ddPCR）法

微基生物提供基于液滴数字PCR（ddPCR）的探针/引物设计服务。无需标准曲线，直接对目标菌种进行绝对定量分析。特别适用于临床样本、环境样本及低丰度菌种的检测。

客户提供信息 

目标菌种/属的拉丁文全名。

目标菌种的全基因组序列或靶标基因序列。

案例分享 

Detecting and quantifying Veillonella by real-time quantitative PCR and droplet digital PCR.（2024年）

针对维洛内拉菌（Veillonella）低丰度样本的检测需求，设计特异性引物和探针，评估qPCR和ddPCR方法的特异性和敏感性。

研究方法

1.基于16S rRNA基因序列设计引物和探针，进行qPCR和ddPCR检测。

2.使用模拟临床样本测试两种方法的特异性和灵敏度。

3.收集炎症性肠病（IBD）患者的临床样本，验证检测系统的有效性。

研究结果

1.qPCR的检测灵敏度100拷贝/μL，能够准确检测10³到10⁸CFU/mL的Veillonella浓度。

2.ddPCR的检测灵敏度为11.3拷贝/μL，适合检测10¹到10⁴CFU/mL的低丰度样本。

3.临床样本中，qPCR和ddPCR的检测结果与平板计数法一致，验证了检测系统的准确性。

4.通过ddPCR检测到的Veillonella种类包括V.dispar、V.nakazawae和V.rodentium。      

qPCR检测的灵敏度和特异性结果 

             

 ddPCR检测的灵敏度和特异性结果

qPCR和ddPCR均适用于检测和定量维洛内拉菌，其中qPCR更适合检测较高丰度的样本，而ddPCR更适合检测低丰度的样本。

 

微基生物致力于为微生物研究提供全面、高效的解决方案。选择菌种/属特异性TaqMan探针/引物设计与检测服务，让您的实验更高效、更可靠！