厌氧/肠道菌分离培养

高效筛选、高通量测序、目标菌株筛选、全流程化服务

 

服务简介肠道微生物参与消化、吸收、免疫调节等多个生理过程。通过分离培养肠道微生物，可以深入了解肠道微生物群落的组成和功能，为疾病诊断、治疗以及个性化营养方案的制定提供依据。

微基生物提供肠道菌群微需氧/厌氧、靶向/非靶向分离培养服务。结合高通量测序和培养技术，帮助客户获取尽可能多的菌株及特定目标菌株。

服务亮点

高效筛选：采用多种培养基和培养条件，高通量培养组学显著提高筛选效率。

高通量测序：结合二代高通量深度测序技术，提高微生物分离培养的效率和准确性。

目标菌株筛选：根据研究需求，靶向筛选具有特定功能及生物学分类的目标菌株。

全流程化服务：从样本检测到菌株纯化、鉴定及扩繁，一站式解决客户需求。

服务流程

1.样本检测

对原始样本进行二代高通量测序，检测样本中微生物的种类及其相对丰度。

2.培养条件确定

根据测序结果，确定目标菌株的培养条件和培养基。

3.微生物培养与纯化

利用选定的培养基和培养条件进行培养，利用96孔板进行大规模的分离和纯化。

4.菌种鉴定

对最终纯化好的菌株进行基因水平的菌种鉴定，确认菌株的分类学属性。

5.功能验证

根据需要，对筛选出的目标菌株进行功能验证。

样本类型

粪便样本、肠道组织样本、动物粪便样本等。

样本保存和寄送

采集新鲜粪便样本后，立即放入厌氧活菌保存液中。尽快置于-80℃冻存。

所有样本采集完成后，在冰盒中邮寄至检测公司。

案例分享

案例1：Isolation and Cultivation of Human Gut Microorganisms: A Review.2023

文献综述了人类肠道微生物的分离和培养策略，重点介绍了培养组学的非靶向和靶向策略。非靶向策略通过在多种培养基上培养样本，尽可能多地分离微生物；靶向策略则利用分子生物学、生物信息学等技术，针对特定微生物进行分选和培养。

 案例2：比较健康志愿者配对的粪便和直肠活检样本的微生物特征（Comparison of microbial signatures between paired faecal and rectal biopsy samples from healthy volunteers using next-generation sequencing and culturomics.2022）

文献研究通过比较健康志愿者配对的粪便和黏膜微生物群的特征，以验证粪便样本是否可以作为直肠活检相关微生物群的替代品。

样本类型：健康志愿者的粪便和直肠活检样本。

研究方法：通过细菌培养和16S测序，比较粪便与直肠活检样本的微生物特征。

研究结果：配对粪便和直肠活检清洗样本的细菌特征非常相似，验证了粪便样本作为直肠活检相关微生物群的便捷替代品的用途。

不同粪便和直肠活检样本类型间微生物特征的比较  门/属级别

粪便和直肠活检冲洗样品间的物种多样性比较 

样本间细菌培养与测序结果对比图