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胃粘膜样本和组织样本的采集保存方法

 1 样本的采集

根据实验的目的,确定选择受试者的条件,如考虑年龄、性别、有无特殊疾病史等因素。根据考虑的因素,选择符合条件的受试者。向受试者交代实验的目的、过程、风险、收益及退出机制等,确保受试者理解全部实验内容,待受试者签订知情同意书后开始取样。

由于胃部粘膜样本和组织样本在取样时,取样的大小不同,后续的 DNA 抽提方法不同,因此采样方法也不相同。

1.1 胃部粘膜样本

在做胃镜检查前需禁食 12 小时,且未服用任何影响胃内菌群的药物。 用无菌的胃镜钳取胃部粘膜组织样本,胃窦样本取距离幽门 2-3cm 处的粘膜组织,胃体样本取距离胃食道结合部 10cm 处大弯侧的粘膜组织,样本大小至少为 2mm*1mm,置于无菌 EP 管或冻存管中,做好标记,放入液氮罐中进行保存。 当取材结束后,将样本转运到实验室,放入-80℃冰箱进行低温保存。注意在样本冻存期间,请勿反复冻融。

1.2 组织样本

取待测的组织样本放入微基生物提供的装有保存液的室温保存管中,样本加入后,保存液上升体积,不能超过原保存液体积的 1/3,在样本加入后,请充分 振荡,使样本全部浸没在保存液中。

装有保存管的样本,可在室温下存放 14 天,样本的菌群结构保持稳定。如
需长期保存,将放有样本的保存液,放入-80℃冰箱长期(1 年内)冻存,或短期(3 月内)放于-20℃冰箱中。注意在样本冻存期间,请勿反复冻融。

*如需保存活菌,需使用活菌保存管,并请尽快将样本及保存液放置于-80℃冰箱中,避免反复冻融。

 2 样本的保存和寄送

送样时请尽量使用冰盒(泡沫盒+干冰+冰袋),以保证运输过程中的低温条件(干冰的挥发消耗量约为 3 公斤/天)。在打包时先放入足量的干冰,之后用冰袋填充泡沫盒中间的空隙,为了保持冰盒中的低温环境,建议采用较厚的泡沫盒。

 参考文献

[1] Paroni Sterbini F., Palladini A., Masucci L., el al. Effects of Proton Pump Inhibitors on the Gastric Mucosa-Associated Microbiota in Dyspeptic Patients[J]. Applied and Environmental Microbiology, 2016, 82: 6633-6644.

[2] Brandi G., Biavati B., Calabrese C., et al. Urease-positive bacteria other than Helicobacter pylori in human gastric juice and mucosa[J]. The American Journal of Gastroenterology, 2006, 101: 1756-1761.

[3] Sanduleanu S., Jonkers D., De Bruine A., et al. Non-Helicobacter pylori bacterial flora during acid-suppressive therapy: differential findings in gastric juice and gastric mucosa[J]. Aliment Pharmacol Ther , 2001, 15: 379-388.

[4] 王子恺. 胃癌、胃息肉患者胃内微生物群落结构的研究[D]. 解放军医学院,2014.