关于微基生物

　　微基生物致力于协助科研人员探索微生态与健康、生产、环境之间隐藏的奥秘，更好地利用微生物资源。
　　同时开展Illumina Miseq、　Ion PGM及Roche 454二代高通量测序分析，PacBio第三代高通量测序分析，PCR-DGGE变性梯度凝胶分析，克隆文库等多种微生态分析方法的公司。公司拥有经验丰富的技术团队，涉及分子生物学、医学、生物信息学、统计生态学方面，核心成员具有10余年一线科研工作经验。
　　微基生物已完成300余项微生物多样性分析项目，分析样本6000余例。研究对象涉及粪菌、土壤、水体、发酵物、肠道、人体微生物等各类样本。
　　微基生物将继续专注微生态研究，紧跟国际分子生物学技术、生物信息学、统计分析技术发展，以更好的服务质量，协助研究者解码微生物世界的奥秘！

分析案例

案例分析案例：某类细菌在相关疾病爆发过程中与其他细菌/真菌的相关性。

　　分析方法：相关性分析是用于分析微生物间相互作用关系的经典方法，可甄别出微生 物群落间（包括细菌、真菌、古细菌等各类检测目标）具有显著相关性、强相关、正相关、负相关的各项。

分析案例：  丁酸盐产生菌的减少和一些致病微生物的增加使得CRC患者肠道微生物菌落的失衡

　　Tingting Wang等采用高通量测序技术研究结直肠癌（CRC）患者与正常人群肠道微生物的菌落组成差异。并结合real-time PCR对相关基因进行分析，最终确定丁酸盐产生菌的减少和一些致病微生物的增加使得CRC患者肠道微生物菌落的失衡。实验对象的数目：CRC患者46人，健康志愿者56人。

Structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers. 2012.  The ISME Journal

分析案例：服用某中草药改变肠道菌群，进而缓解二型糖尿病

　　肠道菌群对新陈代谢疾病（如二型糖尿病T2D）有重要的作用，传统的中草药葛根芩连汤（GQD）对二型糖尿病有缓和作用。
　　为了研究GQD对T2D的调节作用是否通过改变肠道菌群的组成，Jia Xu等对187名T2D患者给予不同剂量的GQD（44名给予高剂量，52名给予中剂量，50名给予低剂量，41名给予安慰剂），对肠道微生物进行研究。高剂量和中剂量处理的样本较低剂量和安慰剂处理的样本中空腹血糖（FBG）和糖化的血红蛋白（HbA1c）显著降低，通过RDA分析，鉴定出47个丰富的种，其中17个与FBG负相关，9个与HbA1c负相关。
实验结果显示，中草药GOD处理可以增加有益微生物的种类，如Faecalibacterium spp。

Structural modulation of gut microbiota during alleviation of type 2 diabetes with a Chinese herbal formula. 2015. The ISME Journal

相关分析方法：采用网络分布图展示不同个体或人群的肠道微生物分布，可以形象的展示不同个体或人群之间的相同物种或是OTU的相似、分布情况。

相关分析方法： 利用冗余分析（RDA）反映在某微生物分类级别上（如属）不同个体肠道菌群差异与健康、药物、饮食之间关系。

专业微生态、微生物多样性分析服务_微基生物，首发于微基生物。

　　重金属在人体中累积达到一定程度，会造成慢性中毒。重金属污染土壤的生态修复主要是利用植物或土壤中天然的微生物资源，削减、净化土壤中重金属或降低重金属毒性，从而使污染物的浓度降低到可接受的水平，或将有毒有害的污染物转化为无害的物质，也包括将污染物稳定化，以减少其向周边环境的扩散。重金属的植物修复，就是利用植物在水或土壤中固定、降解或提取污染物。重金属污染的特点是不能被微生物降解而从环境中彻底消除，只能从一种形态转化为另一种形态。

　　所以重金属的微生物修复通过以下途径：利用微生物化学、微生物有效性和微生物活性原则，把重金属转化为较低毒性产物（络合态、脱烷基、改变价态）；或利用重金属与微生物的亲和性进行吸附及生物学活性最佳的机会，降低重金属的毒性和迁移能力。

　　植物提取修复是植物修复中的一种，即通过植物吸收和转运的方式，转移污染土壤中的污染物进入植物的可收获部分，这相当于是一种对金属的浓缩技术。尽管植物修复虽然克服了微生物修复难以收集的缺点，但过量的重金属往往对植物生长产生抑制，且修复植物的生物量太小，修复过程缓慢。因而将二者结合起来利用微生物强化重金属植物修复，可使生物修复效果的有效性得以提高。

在重金属污染土壤的生态修复过程中微生物主要通过以下几种方式起作用：

　　1.通过微生物的吸附、代谢达到对重金属消减、净化作用和固定作用；
　　2.通过微生物改变重金属的化学形态，使重金属固定或生物可利用性降低，减少重金属的危害；
　　3.土壤微生物过氧化还原作用改变根际重金属形态或产生的有机酸等方式可能增加金属的溶解性，提高重金属的有效性，以利于植物吸收；
　　4.通过促进植物作物生长、提高植物抗病、抗逆能力等方式间接影响修复效率。

重金属污染，首发于微基生物。

       宏基因组学以微生物的多样性、种群的结构、进化关系、功能活性、相互间的协作关系以及与环境之间的关系为研究目的，其研究方法有功能基因筛选及测序分析。运用的技术手段包括环境基因组整体测序及特征基因的扩增子序列。

优点：

           宏基因组不依赖于微生物的分离培养，克服了传统的纯培养方法的技术限制，为研究和开发利用占微生物种类99%以上的未可培养的微生物提供了一种新的途径和良好的策略；

        ‚ 可以得到环境中丰度较低的，甚至是痕量微生物的信息，为研究低丰度微生物提供了途径；

ƒ        宏基因组学引入了宏观生态的研究理念，对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究，可以更准确地反应出微生物生存的真实状态。

微基生物进行人体健康相关的研究与应用：

微基生物提供与人体健康相关的生信/统计服务：

更多微生态方向研究和生物信息方面服务，请详询：400-660-9270

高通量分析流程：

微生物多样性及宏基因组分析，首发于微基生物。