微基生物是专注于从事微生态研究的公司，具有Illumina MiSeq、Ion PGM等高通量测序分析，以及PCR-DGGE、Real-Time PCR等多种微生态分析平台。微基生物提供整套微生态研究方案：涵盖实验设计、样本采集、保存、预实验与改进、数据分析与解析。 专业、用心，微基生物努力做得更好！

肠道菌群与健康整体研究方案：

　　微基生物提供整体研究方案：研究健康人群与病患肠道菌群差异、药物/饮食干预前后区别、营养成分及药物浓度对肠道菌群的影响…

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皮肤微生态与健康整体研究方案：

　　微基生物针对皮肤微生物数量相对较少的特点，优化实验方法，增加对痕量微生物的检出率，为您研究正常、疾病状态下皮肤微生物数量、种类及差异等，提供全面、整体的研究方案。

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口腔微生物整体研究方案：

　　针对口腔微生物的特点，微基生物采用优化的实验方法，更加准确地分析口腔微生物的多样性，及其与疾病、免疫系统的关系。

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鼻咽微生物整体研究方案：

　　微基生物为您提供整体研究方案，分析鼻/咽微生物的群落结构、多样性等，研究鼻/咽中与健康、疾病等相关的微生物，及其与疾病的关系。

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生殖道微生物整体研究方案：

　　微基生物提供从采样到后续数据分析的整体研究方案，分析在不同时期（产前产后）、不同条件下（生殖道感染）生殖道微生物的变化，及其与宿主、婴儿等健康的关系。

微基生物科技（上海）有限公司

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人体微生态（宏基因组）与健康的整体研究方案_微基生物，首发于微基生物。

目前微基生物已与中科院、北京大学、清华大学、长征医院、红房子医院等多所高校科研院所和三甲医院合作，已检测过人、小鼠、大鼠、猴子等多种动物的粪便及肠道内容物。微基生物可采用二代高通量测序、三代高通量测序、PCR-DGGE等方法，对样本中微生物的DNA进行测定，并通过生信统计分析，对大量数据进行处理，揭示肠道中微生物的种类以及它们之间的相对丰度和进化关系；还可以通过实时荧光定量PCR方法，定量的研究肠道菌群，探讨微生物多样性，研究肠道微生物与环境间的相关关系；还可以通过厌氧培养，获得肠道微生物中的菌种，从菌株水平上研究肠道微生物的功能和作用。

目前肠道微生物的主要研究方向：
（1）寻找疾病组和健康组间肠道菌群的差异：
分别采集健康人群和疾病人群的粪便样本，比较健康组和疾病组之间肠道菌群的差异，寻找与疾病相关的marker，这是目前最典型的研究方法；
（2）研究药物或饮食干预群体的肠道菌群：
分别采集药物或饮食干预前、后的群体的粪便样本，比较个体在不同干预阶段的肠道菌群的差异；
（3）同一群体、不同生长发育时期的肠道菌群：
如分别采集婴儿出生后0个月、4个月、12个月等时间的粪便样本，对婴幼儿的肠道菌群进行研究；
（4）研究某一疾病发生发展进程中的群体的肠道菌群：
如分别选择健康人、结直肠腺瘤患者（大部分的结直肠癌由腺瘤演变而来）、结直肠癌患者群体，研究与结直肠癌疾病进程相关的marker；
（5）研究同一群体多个身体部位的微生物：
如分别选取同一人群的粪便、唾液、牙菌斑等样本进行关联分析。

微基生物可以做什么：
（1）研究样本中微生物的种类及其对应的丰度；
（2）对样本中某一种微生物进行定量；
（3）通过厌氧培养获得样本中微生物的菌株。

微基生物提供肠道微生物多样性分析的整体科研服务：实验规划->样本采集保存->分子实验->生信统计分析->论文协助

已检测对象：
人、小鼠、大鼠、猴子、鸡、羊、鱼、马、驴、熊猫、穿山甲等动物的粪便或肠道内容物；

检测类型：
细菌、真菌、放线菌等；

检测方法：
二代高通量测序、三代高通量测序、PCR-DGGE、实时荧光定量PCR、厌氧培养；

检测平台：
（1）微基生物拥有Illumina MiSeq、Ion PGM高通量测序分析，PacBio第三代高通量测序分析，PCR-DGGE变性梯度凝胶分析，实时荧光定量PCR（Real-time qPCR），克隆文库等检测平台。
（2）具有厌氧培养系统，可以分离粪便样本中的微生物。

样本采集耗材：
为客户提供样本采集保存耗材，包括粪便采集盒、常温保存液、取样勺和保存管等。

样本采集方法：
（1）人粪便：采集新鲜的、中后段、内部的粪便样本，每个样本需1g，采好后立刻冻存于-80℃冰箱，保存期间切记反复冻融。
（2）小鼠粪便：建议采用拎尾法或者代谢笼采集新鲜粪便，每个样本需1g，采好后立刻冻存于-80℃冰箱，切记反复冻融。
（3）大鼠粪便：可采用代谢笼采集新鲜粪便样本，每个样本需1g，采好后立刻冻存于-80℃冰箱，切记反复冻融。
对于其他样本的采集，可咨询微基生物技术支持，400-660-9270.
若无法实现低温保存，可采用微基生物研发的常温采集保存套装，可在常温下保存14天。

送样要求：
（1）粪便样本或肠道内容物样本：每样本需1g，新鲜取样，冻存于-80℃，保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输；
（2）DNA样本：DNA总量≥300ng，浓度≥10ng/μL，OD260/280=1.8-2.0，并确保DNA无降解，样本保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。

技术路线：

高通量分析流程

PCR-DGGE分析流程

生物信息与统计学服务：

案例分析：

标题：巴布亚新几内亚人肠道微生物：组成，多样性及生态形成过程 （Cell Reports, IF: 8.358）

研究领域：肠道微生物

分析物种：细菌

高通量测序平台：Illumina MiSeq

测序区域：16S rRNA gene V5-V6 region

主要结果：

(1）PNG和US人群肠道微生物多样性分析

（2）细菌多样性图谱

　　（3）

（4）

原文链接：http://www.cell.com/cell-reports/abstract/S2211-1247(15)00340-Xv

参考文献：

Martinez, I., J. C. Stegen, M. X. Maldonado-Gomez, A. M. Eren, P. M. Siba, A. R. Greenhill and J. Walter (2015). “The gut microbiota of rural papua new guineans: composition, diversity patterns, and ecological processes.” Cell Rep 11(4): 527-538.

微基生物进行人体健康相关的研究与应用：

肠道微生态，首发于微基生物。

微生态与健康，首发于微基生物。