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靶向分离培养

通过高通量、PCR-DGGE方法仅仅可以检测到样本中微生物的种类和相对丰度,但无法拿到具体的菌株。通过厌氧或需要条件下的靶向分离培养技术,可以获得特定的菌株。

首先通过二代( Illumina)、三代高通量测序(PacBio)技术检测样本中微生物的种类及其相对丰度,确定样本中是否有目标微生物,在确定目标微生物的相对丰度后,通过厌氧或需氧培养系统、不同配方的培养基进行培养、分离、纯化等操作,找到目标菌株。对纯化好的目标菌株进行高通量测序鉴定,从基因水平上确定目标菌株。

具体流程:

 Target-isolation-culture

技术平台:

厌氧培养系统

二代高通量测序平台